Para Hunter mengabdikan diri mereka untuk menyelesaikan tugas-tugas berbahaya, mulai dari menjelajahi wilayah-wilayah yang belum dipetakan di dunia hingga menemukan barang-barang langka dan monster. Sebelum menjadi Hunter, seseorang harus lulus Ujian Hunter proses seleksi berisiko tinggi yang membuat sebagian besar pelamar berakhir cacat atau lebih buruk lagi, meninggal.
Peserta ambisius yang menantang ujian terkenal itu memiliki alasan mereka sendiri. Yang mendorong Gon Freecss yang berusia 12 tahun adalah menemukan Ging, ayahnya, dan seorang Hunter sendiri. Percaya bahwa ia akan bertemu ayahnya dengan menjadi Hunter, Gon mengambil langkah pertama untuk menapaki jalan yang sama.
Selama Ujian Hunter, Gon berteman dengan mahasiswa kedokteran Leorio Paladiknight, Kurapika yang pendendam, dan mantan pembunuh Killua Zoldyck. Meskipun motif mereka sangat berbeda satu sama lain, mereka bersatu untuk tujuan yang sama dan mulai menjelajah ke dunia yang berbahaya.
