The “Noblesse” Cadis Etrama di Raizel, juga dikenal sebagai “Rai,” didaftarkan di Ye Ran High School oleh pelayannya Frankenstein untuk tetap tersembunyi dari pemandangan Union, sebuah organisasi misterius yang mencari darah Rai. Rai memulai kehidupannya sebagai murid, membuat dirinya akrab dengan teman sekelasnya dan aktivitas manusia sehari-hari. Namun, kehidupan barunya jauh dari kedamaian, dan Rai segera terpaksa menyelamatkan teman-teman barunya dari tangan Union yang telah menculik mereka.
Sementara itu, M-21 — seorang agen Union menjadi nakal selama operasi penyelamatan Rai — bergabung dengan staf keamanan SMA Ye Ran setelah proposisi dari direktur sekolah, yang kebetulan tak lain adalah Frankenstein sendiri. Di permukaan, M-21 adalah karyawan yang sopan dan pantas, tetapi sebenarnya dia terbelenggu oleh ikatan sebelumnya dengan Union dan konsekuensi yang tak terhindarkan dari pengkhianatan terhadap organisasi.
Untuk lebih memperumit masalah, Bangsawan Regis K. Landegre dan Seira J. Loyard mendaftar di sekolah yang sama untuk menyelidiki Noblesse. Saat Union melakukan perburuan agar M-21 mendapatkan petunjuk mengenai agen mereka yang hilang, Rai dipaksa untuk menyembunyikan identitasnya sambil melindungi semua yang dia sayangi.
